索馬利蘭醫療團
2021年8月7日，中華民國外交部與索馬利蘭共和國(以下簡稱索國)簽定臺索醫療協定，約定將派遣醫療團常駐索國，由臺北醫學大學(以下簡稱本校)與中華民國外交部簽定「駐索馬利蘭共和國醫療服務計畫」合約，並交由台北醫學大學辦理之臺北市立萬芳醫院(以下簡稱萬芳)主責規劃及執行。執行醫療服務計畫包含：臨床醫療服務、醫療衛生人員能力建構、社區公衛防治等項目。
臺灣駐索馬利蘭醫療團(以下簡稱醫療團)，將提供臨床診斷、護理照護、公共衛生等面向的醫療服務外，不僅針對當地需求辦理醫療人員培訓，同時針對索國醫療衛生現狀持續進行技術交流與評估，以規劃最符合索國現況的醫療發展計畫。強調提供公平且高品質的基礎健康服務、加強疾病及感染控制預防與控制，以及建立可持續的健康系統。索馬利蘭在獨立建國後，面臨諸多健康挑戰，特別是在基礎設施、急重症醫療、感染控制及健康資訊管理等領域。
史瓦帝尼癌症計畫
史瓦帝尼王國長年面臨癌症治療困境，過去病患多經王母基金會轉介至南非就醫，但因等候時間長、可近性差，當地的不確定性因素常導致療程無法持續。為協助改善當地癌症醫療，臺北醫學大學自2019年起派遣腫瘤科、病理科及護理人員駐點史國，包括來自尚比亞、衣索比亞與辛巴威的醫師，共同進行臨床診斷、教學與病人照護。其中病理團隊於半年內完成逾1,100件積壓檢體，大幅提升診斷效率與品質。
史國近年積極建構癌症醫療基礎設施，包括2015年成立化療中心、2021年啟用癌症醫院、2024年導入藥品條碼與電子病歷系統，並於2025年啟用病理專用組織處理器與首輛行動病理檢驗車，強化偏鄉篩檢服務。
菲律賓
萬芳醫院自2024年起承接衛生福利部新南向政策之「醫療合作與產業發展計畫」，聚焦菲律賓B區，推動AI醫療應用與醫療合作。2025年4月，團隊赴菲設立AI示範點並辦理義診：於Philippine General Hospital導入骨質疏鬆AI診斷工具，於Chinese General Hospital導入糖尿病視網膜病變AI系統「VeriSee DR」，並於Cavite省參與義診服務1,468人次。
為深化交流，本院於4月及6月開設英語與他加祿語課程，提升跨文化溝通能力。同年7月接待菲律賓衛生部與衛福部等單位代表30人，分享器官移植與癌症治療經驗。9月14日至20日代表團赴菲訪問多家重要醫療機構，並於9月18日舉辦「Shaping Tomorrow Together: Taiwan–Philippines AI Innovations in Smart Healthcare」國際研討會，促進雙邊在AI智慧醫療與人才培育之合作。
此外，本院於2025年6月12日通過穆斯林友善環境驗證，展現持續推動跨文化友善醫療與國際合作的承諾。
