沿革
萬芳醫院所在地是昔日「萬隆」與「芳川」兩礦場，「萬芳」之名由此而來。自 1989 年動工興建，於 1997年2月15日正式開幕服務民眾，由臺北市政府委託臺北醫學大學籌設經營，為臺北市第一家公辦民營的市立醫院。傳統醫學科於1997年3月成立，並於1998年分為中醫內、婦、兒、針灸等專業分組。
目前傳統醫學科有專任主治醫師三名、兼任主治醫師一名。診療服務項目包括一般內科（皮膚科、五官科）婦兒科、針灸、各種腫瘤疾病及各類慢性疾病等項目。
診療服務項目
-
內
除一般過敏性鼻炎、皮膚炎、腸胃疾病、高血壓、糖尿病等疾病外，更提供類風濕關節炎等免疫疾病，癌症、高齡失智、骨鬆肌少、失眠焦慮的養護調理。
-
婦
提供經期調理、妊娠安胎養護、產後調理、卵巢、子宮等不適治療養護。
-
兒
除過敏性鼻炎、皮膚炎治療，亦有提供調理腸胃增進轉骨發育、考生考期壓力調理。
-
針灸
除了一般疼痛治療外，並結合薰臍、溫灸、穴位敷貼(三伏天、三九)治療，改善過敏、氣喘、虛寒體質、生理疼痛等問題。
目標與願景
中醫是中國幾千年來的傳統醫學，雖然與現代醫學源自不同的理論體系，在臨床運用上卻各有所長。本科繼承傳統中醫之望、聞、問、切為基礎，合併西醫尖端之儀器檢查，以求確定診斷，給予純粹中藥治療各類疾病，本著服務民眾的理念，傳統醫學科積極建設科內軟、硬體設備，加強科內醫護人員訓練及注重科內學術進修，強調身、心、靈療法為一體從學術、臨床中探究歷史悠久的傳統醫學。
本科目前著重在門診診療，期望在不久的將來成立中醫部專科訓練中心，以期訓練出更多優秀的中醫師，更朝中西一元化、科學化，並配合西醫醫學與萬芳醫學中心一同提供高品質的醫療服務。